एनसीईआरटी की पाठ्यपुस्तकों में बदलाव के बाद लगातार सवाल उठ रहे हैं। NCERT किताबों के संशोधन के बाद विपक्ष ने मोदी सरकार पर निशाना साधा है। कांग्रेस के पूर्व दिग्गज नेता और राज्यसभा के सदस्य कपिल सिब्बल ने 12वीं कक्षा की राष्ट्रीय शैक्षणिक अनुसंधान और प्रशिक्षण परिषद यानी NCERT की किताबों में से कुछ अध्याय को हटाए जाने की खबरों को लेकर स्पष्ट रूप से केंद्र सरकार पर कटाक्ष करते हुए कहा कि प्रधानमंत्री नरेन्द्र मोदी के भारत के अनुरूप, आधुनिक भारतीय इतिहास 2014 से आरंभ होना चाहिए। वहीं, असदुद्दीन ओवैसी ने केंद्र सरकार पर हमला बोलते हुए आरोप लगाया कि केंद्र सरकार एनसीआरटी की किताबों से मुगल इतिहास मिटाने में जुटी है। वहीं, चीन वर्तमान मिटा रहा है।