माथा कुंवर मंदिर और उसके सामने स्थित पुरातात्विक अवशेष बरसात में जलभराव से बने तालाब दिख रहे हैं। अब बरसात खत्म होने के बाद अक्तूबर-नवंबर में जब पानी सूखेगा, तब ही इनके दर्शन हो सकेंगे। इस बाबत पीडब्ल्यूडी के जेई आरएन राव का कहना है कि पानी में डूबे रहने से पुरावशेषों का क्षरण होता है।
हालांकि, सारनाथ मंडल के पुरातत्वविद् नीरज सिन्हा का कहना है कि पानी में डूबने से उत्खनित पुरावशेषों को कोई नुकसान नहीं होता। विभाग हर साल पानी हटने के बाद क्षतिग्रस्त हिस्से की मरम्मत करा देता है। हालांकि उन्होंने इसका एक मसौदा तैयार कर भारतीय पुरातत्व सर्वेक्षण नई दिल्ली को भेजने की भी बात कही है। मसौदा संस्कृति मंत्रालय में लंबित है।
पर्यटन सूचना अधिकारी राजेश कुमार भारती ने कहा कि महापरिनिर्वाण मंदिर, माथा कुंवर मंदिर व रामाभार स्तूप परिसर में पानी में डूबे उत्खनित पुरावशेषों का निरीक्षण किया गया है। ये तीनों स्थल भारतीय पुरातत्व सर्वेक्षण विभाग के संरक्षित स्थल हैं। इसलिए यहां से जल निकासी के लिए रिपोर्ट तैयार कराकर विभाग को पत्र भेजा जाएगा। उन्होंने कहा कि इस संबंध में अधीक्षण पुरातत्वविद से भी वार्ता की जाएगी। इन स्थलों पर भविष्य में जलभराव न हो, इसके लिए बंदोबस्त किया जाएगा।