जिले में बढ़ते अपराध के साथ ही पुलिस मुठभेड़ की घटनाएं भी बढ़ी हैं। पिछले 82 दिनों के भीतर पुलिस और बदमाशों के बीच हुई मुठभेड़ की 12 घटनाएं हुई हैं। जिसमें पुलिस की गोली से तीन बदमाश मारे गए, जबकि पैर में गोली लगने से 12 घायल हुए हैं। कुल 17 लोग गिरफ्तार हुए हैं। हालांकि मुठभेड़ की कुछ घटनाओं की पुलिस की ओर से तैयार की गई कहानी पर सवाल भी उठते रहे हैं। मुठभेड़ की ये सभी घटनाएं मौजूदा पुलिस कप्तान अजय कुमार साहनी के कार्यकाल में हुई हैं।
एसपी अजय साहनी के कार्यभार ग्रहण करने के तीसरे दिन 19 जून की रात महराजगंज थाने की पुलिस और क्राइम ब्रांच की संयुक्त टीम ने भटपुरा नहर पुलिया के पास बालिका के साथ दुष्कर्म और हत्या के मामले में आरोपी अच्छेलाल दफाली निवासी तरहटी मुंगराबादशाहपुर को मुठभेड़ में गिरफ्तार किया था। इसके बाद एक-एक कर मुठभेड़ की घटनाएं सामने आने लगीं। बीते माह 9 अगस्त की रात सिंगरामऊ, बदलापुर, बक्शा थाने की पुलिस और क्राइम ब्रांच की टीम ने बहरा पार्क के निकट पीली नदी के किनारे हुई मुठभेड़ में दो बदमाशों को मार गिराया था। मारे गए गए बदमाश सिंगरामऊ थाना क्षेत्र के सिरकिना निवासी नितिन मौर्य और अभिषेक गौतम निवासी सरोखनपुर थाना बदलापुर शामिल थे। इन पर आरोप थे कि इन्हीं दो बदमाशों ने सोमवार को धनियामऊ बाजार में एटीएम कैश वैन के गार्ड की हत्या कर लूट का प्रयास किया था। इसी तरह 8 सितंबर की करीब रात ढाई बजे जनपद में लूट, हत्या, डकैती, चोरी, रंगदारी जैसे 29 वारदात को अंजाम देने वाले प्रशांत पांडेय उर्फ कल्लू पांडेय निवासी ग्राम अमरेथू डडिया थाना कादीपुर जनपद सुल्तानपुर को सरपतहां इलाके में मुठभेड़ में ढेर कर दिया। इसके पहले हाल ही में जलालपुर, मीरगंज और शहर कोतवाली इलाके में भी पुलिस ने मुठभेड़ में बदमाशों कोे गिरफ्तार किया है।