बेनी प्रसाद वर्मा ने 2009 में समाजवादी पार्टी से इस्तीफा देकर कांग्रेस का दामन थामा और 2009 के लोकसभा चुनाव में गोंडा से सांसद बनकर वह यूपीए-2 सरकार के दौरान इस्पात मंत्री भी रहे। 2016 में वह फिर से समाजवादी पार्टी में शामिल हो गए थे।
बेनी प्रसाद वर्मा मुलायम सिंह यादव के करीबी और उनके संघर्ष के साथी थे। 1996 में वह राष्ट्रीय मोर्चा-वाम मोर्चा की एचडी देवगौड़ा की सरकार में संचार मंत्री थे। इसके अलावा उन्हें संसदीय कार्य मंत्री की भी जिम्मेदारी सौंपी गई थी। वह यूपी में समाजवादी पार्टी की सरकार में पीडब्ल्यूडी मंत्री भी रहे।