बाढ़ के कारण बुरी तरह से प्रभावित घाटी में स्थित अधिकतर बड़े अस्पताल अब भी पानी से भरे हैं। बाढ़ के कारण जगह-जगह जलभराव होने से सभी अस्पतालों में पानी भरा हुआ है, जिससे घाटी में स्वास्थ्य व्यवस्था गड़बड़ा गई है।
अस्पतालों में लगी करोड़ों रुपयों की लागत की मशीनें भी बुरी तरह से खराब हो चुकी हैं। श्रीनगर शहर में लोगों को स्वास्थ्य सुविधा मुहैया करवाने के लिए स्वास्थ्य एवं मेडिकल शिक्षा विभाग की ओर से 58 मोबाइल हेल्थ क्लीनिक खोले गए हैं।
जीबी पंत, ललदेद और एसएमएचएस अस्पतालों से पानी को बाहर निकाल दिया गया है। घाटी के अन्य बाढ़ प्रभावित इलाकों में चार मोबाइल अस्पताल बनाए हैं, ताकि लोगों को स्वास्थ्य सुविधा आसानी से मिल सके।