मेडिकल काउंसलिंग कमेटी हर साल 50 प्रतिशत अखिल भारतीय कोटा (एआईक्यू) के तहत देश के सरकारी मेडिकल और डेंटल कॉलेजों में स्नातकोत्तर - एमडी, एमएस, डिप्लोमा और एमडीएस - सीटों के लिए योग्य उम्मीदवारों को अवसर प्रदान करती है। नीट एमडीएस के लिए राउंड 3 काउंसलिंग के बारे में यह बताया गया है कि जिन उम्मीदवारों को राउंड 2 में भाग लेने के दौरान सीट आवंटित नहीं की गई थी, वे सीधे राउंड 3 काउंसलिंग में शामिल हो सकते हैं।