शाहजहांपुर में तत्कालीन मानव संसाधन विकास मंत्री मुरली मनोहर जोशी द्वारा संचालित की गई मदरसा आधुनिकीकरण योजना में ग्रहण लग गया है। मदरसों में दीनी के साथ दुनियावी तालीम देने के लिए नियुक्त किए आधुनिक शिक्षकों की नौकरी पर तलवार लटक रही है। योजना का रिन्यूवल न होने के कारण 272 शिक्षक पसोपेश में हैं।
मदरसों में आधुनिक विषयों की शिक्षा देने के लिए मानव संसाधन विकास मंत्रालय ने योजना को शुरू किया था। उसके बाद अल्पसंख्यक समुदाय के लोगों ने मदरसों की स्थापना कर योजना को कामयाब करने को दिलचस्पी दिखाई। योजना से लाभ प्राप्त करने वाले मदरसा में दीनी तालीम के साथ-साथ आधुनिक विषय हिंदी, अंग्रेजी, गणित, विज्ञान व सामाजिक विषयों की शिक्षा छात्रों को मिलने लगी।